Основных особенностей было три:
1. Оценке подлежали многопрофильные организации. Часто их структурные подразделения входили в разные референтные группы. В этих случаях выставленные им оценки в итоге сводились в интегральную.
2. Было решено разделить компетенции экспертов. Специалисты РАН анализировали научные результаты, а уполномоченная организация оценивала центр или вуз в целом как площадку для исследовательской деятельности.
3. Промежуточные итоги дополнительно рассматривали две рабочие группы - по ФИЦ и по вузам. Далее решения рабочих групп и все собранные материалы передавались в ведомственную комиссию при Минобрнауки России, где деятельность организаций анализировалась подробно и по существу.
Финальную оценку ставила Межведомственная комиссия Министерства науки и высшего образования Российской Федерации, которая принимала решения на основе наукометрических показателей, заключений ведомственных комиссий и экспертизы РАН.
По итогам работы Межведомственной комиссии Министерства науки и высшего образования Российской Федерации вузы, выполняющие научно-исследовательские, опытно-конструкторские и технологические работы, приказом Министерства науки и высшего образования Российской Федерации от 26 декабря 2019 года № 1423 распределены на три категории следующим образом: 32 вуза - первая категория, 96 вуза - вторая, 64 вуза - третья.
Костромской государственный университет вошел во вторую категорию образовательных организаций высшего образования.
Согласно правилам оценки и мониторинга результативности деятельности научных организаций, выполняющих научно-исследовательские, опытно-конструкторские и технологические работы гражданского назначения, утвержденным постановлением Правительства Российской Федерации от 8 апреля 2009 года №312, проведение оценки результативности деятельности научных организаций является обязательным и осуществляется не реже, чем 1 раз в 5 лет.